Oreki Hotaro é um estudante do ensino médio. Um dia, ele se junta ao clube de literatura clássica da escola a pedido de sua irmã mais velha. Lá ele conhece Chitanda Eru, Fukube Satoshi e Ibara Mayaka. Eles começam a investigar um caso que ocorreu há vários anos atrás. As dicas deste mistério se encontram em uma obra intitulada "Hyouka", feita através de dados coletados pelo antigo clube de literatura clássica. Assim, o grupo de amigos passa a resolver casos misteriosos que ocorrem dentro e fora da escola.