Em comemoração aos 20 anos da franquia, Persona 5 the Animation: THE DAY BREAKERS mostra a história do protagonista de 16 anos depois que é transferido para Shujin High School, em Tóquio. Permanecendo com os amigos de seus pais, ele encontra-se com dois colegas estudantes, Ryuuji Sakamoto e Anne Takamaki. E uma criatura falante em forma de gato, chamada de Morgana. Sentindo-se suprimido por seu ambiente, os quatro formam um grupo conhecido como os "Phantom Thieves", trabalhando juntos para realizar assaltos e encontrar fenômenos misteriosos ao longo do caminho.