Baseado na novela The White Ship, do escritor quirguiz Chingiz Aitmatov, Shambala conta a história de um menino de sete anos solitário e impressionável que vive em uma floresta protegida, no alto das montanhas, com seu avô, sua madrasta, tia e tio. Ele passa seu tempo explorando e ouvindo lendas de seu avô, em particular contos sobre a sagrada Mãe Veado. O mundo dos mitos e do folclore acaba entrando em conflito com a dura realidade do mundo dos adultos, que enfrentam seus próprios problemas e dilemas pessoais.